В письме Минфина от 28 марта 2011 г. № 03-02-08/32 рассмотрен вопрос о законности выездных налоговых проверок обособленных подразделений, не являющихся филиалами или представительствами организации.
В частности, изложен ответ на вопрос, могут ли налоговые службы проводить выездные проверки магазина по вопросам правильности исчисления и уплаты ЕНВД.
Минфин на это отвечает, что налоговый орган вправе проводить проверку филиалов и представительств, в т.ч. и по вопросам уплаты региональных налогов на основании решения налогового органа по месту нахождения обособленного подразделения. Однако Налоговый кодекс РФ не предусматривает проверки обособленных подразделений, не являющихся филиалом или представительством организации, в т.ч. и с целью контроля уплаты федеральных налогов по специальным налоговым режимам.